تقدم وحدات المرأة الآمنة خدمات طبية، وفحوصات، وإسعافات أولية نفسية، وإحالة داخلية للمستشفيات، بالإضافة إلى إحالة متعددة القطاعات للخدمات القانونية والاجتماعية للنساء والفتيات اللاتي تعرضن للعنف، بالتنسيق مع المجلس القومي للمرأة. وتقع العيادات في مختلف المستشفيات الجامعية في مصر، بالإضافة إلى مستوى الرعاية الصحية الأولية.